C/EBP Gel Shift Oligonucleotides: sc-2525

Gli oligonucleotidi C/EBP Gel Shift sono brevi sequenze di DNA progettate per essere utilizzate nei saggi di gel shift, una tecnica fondamentale in biologia molecolare utilizzata per studiare le interazioni proteina-DNA. Questi oligonucleotidi sono realizzati sulla base della sequenza di legame consensuale della proteina CCAAT/enhancer-binding (C/EBP), una famiglia di fattori di trascrizione noti per il loro ruolo critico nella regolazione dell'espressione genica e della differenziazione cellulare. Le proteine C/EBP si legano a specifiche sequenze di DNA, spesso situate all'interno di regioni enhancer o promotori di geni bersaglio, e ne modulano l'attività trascrizionale. Utilizzando gli oligonucleotidi C/EBP Gel Shift nei saggi di gel shift, i ricercatori possono esplorare la cinetica di legame, la specificità e l'affinità delle proteine C/EBP alle loro sequenze di DNA bersaglio in varie condizioni sperimentali. Questa tecnica consente di chiarire i meccanismi molecolari alla base della regolazione genica mediata da C/EBP e fornisce indicazioni sulle complesse reti di segnalazione che regolano processi cellulari come il metabolismo, la risposta immunitaria e l'adipogenesi.

Riferimenti:

1. Il fattore di crescita epatocitario attiva la CCAAT enhancer binding protein e la replicazione cellulare attraverso la via della PI3-chinasi.  |  Cho, MK. and Kim, SG. 2003. Hepatology. 37: 686-95. PMID: 12601366
2. L'attivazione rapida e sequenziale di protein chinasi attivate dal mitogeno e di fattori di trascrizione precede l'espressione di mRNA di citochine proinfiammatorie nella milza di topi esposti al tricotecene vomitossina.  |  Zhou, HR., et al. 2003. Toxicol Sci. 72: 130-42. PMID: 12604842
3. L'inibizione dell'espressione dell'ossido nitrico sintasi, del TNF-alfa e della COX-2 indotta dal lipopolisaccaride da parte del sauchinone ha effetti sulla fosforilazione di I-kappaBalpha, sull'attivazione di C/EBP e AP-1.  |  Lee, AK., et al. 2003. Br J Pharmacol. 139: 11-20. PMID: 12746218
4. Induzione della cicloossigenasi-2 da parte del collagene bovino di tipo I nei macrofagi attraverso l'attivazione di C/EBP e CREB da parte di molteplici vie di segnalazione cellulare.  |  Cho, MK., et al. 2004. Biochem Pharmacol. 67: 2239-50. PMID: 15163555
5. L'espressione genica del plasminogeno indotta dall'interleuchina-6 negli epatociti murini è mediata dal fattore di trascrizione CCAAT/enhancer binding protein beta (C/EBPbeta).  |  Bannach, FG., et al. 2004. J Thromb Haemost. 2: 2205-12. PMID: 15613028
6. I glucocorticoidi aumentano l'attività di C/EBPbeta nell'epitelio polmonare attraverso la fosforilazione.  |  Berg, T., et al. 2005. Biochem Biophys Res Commun. 334: 638-45. PMID: 16009338
7. Il 5'UTR del gene bHLH neurogenico Nex1/MATH-2/NeuroD6 è regolato da due promotori distinti attraverso siti di legame CRE e C/EBP.  |  Uittenbogaard, M., et al. 2007. J Neurosci Res. 85: 1-18. PMID: 17075921
8. Un nuovo passaggio RBP-J kappa-dipendente da C/EBP beta a C/EBP zeta nel sito di legame di C/EBP sul promotore della proteina C-reattiva.  |  Singh, PP., et al. 2007. J Immunol. 178: 7302-9. PMID: 17513780
9. La stimolazione dell'espressione genica della MAPK-fosfatasi 1 da parte dei glucocorticoidi avviene attraverso un meccanismo di tethering che coinvolge C/EBP.  |  Johansson-Haque, K., et al. 2008. J Mol Endocrinol. 41: 239-49. PMID: 18682532
10. Il fattore di trascrizione attivante 4 e la CCAAT/enhancer-binding protein-beta regolano negativamente il target mammifero della rapamicina attraverso l'espressione di Redd1 in risposta allo stress ossidativo e del reticolo endoplasmatico.  |  Jin, HO., et al. 2009. Free Radic Biol Med. 46: 1158-67. PMID: 19439225
11. Analisi dell'induzione di Il36a da parte di C/EBPβ attraverso un elemento half-CRE-C/EBP in macrofagi murini in funzione del suo livello di metilazione CpG.  |  Nerlich, A., et al. 2021. Genes Immun. 22: 313-321. PMID: 34697411
12. Coesistenza di C/EBP alfa, beta, proteine indotte dalla crescita e sintesi del DNA negli epatociti durante la rigenerazione del fegato. Implicazioni per il mantenimento dello stato differenziato durante la crescita del fegato.  |  Greenbaum, LE., et al. 1995. J Clin Invest. 96: 1351-65. PMID: 7657810
13. Il legame del DNA da parte delle proteine C/EBP è correlato alla proliferazione degli epatociti.  |  Soriano, HE., et al. 1995. In Vitro Cell Dev Biol Anim. 31: 703-9. PMID: 8564082
14. Clonazione del nuovo fattore di trascrizione C/EBP-epsilon specifico delle cellule mieloidi umane.  |  Chumakov, AM., et al. 1997. Mol Cell Biol. 17: 1375-86. PMID: 9032264
15. Regolazione isoforma-specifica della famiglia di fattori di trascrizione CCAAT/enhancer-binding protein da parte del 3',5'-adenosina monofosfato ciclico nelle cellule del Sertoli.  |  Grønning, LM., et al. 1999. Endocrinology. 140: 835-43. PMID: 9927313