Rpp40阻害剤

一般的なRpp40阻害剤には、アルスターパウロン（CAS 237430-03-4）、アクチノマイシンD（CAS 50-76-0）、ハリントニン（CAS 26833-85-2、ホモハリントニン CAS 26833-87-4、プラディエノライド B CAS 445493-23-2などがある。

Rpp40の化学的阻害剤は、標的とする遺伝子発現の特定の段階に基づき分類することができ、それによってRpp40活性の阻害につながる。アルスターパウロンは、サイクリン依存性キナーゼを阻害することによって細胞周期を標的とし、Rpp40の機能の中心的な活動であるリボソームRNAのプロセシングと成熟に変化をもたらす可能性がある。アクチノマイシンDはDNAに直接結合し、Rpp40が処理するRNAの転写を阻害する。ハリングトニンとホモハリングトニンは、それぞれ翻訳伸長と最初のペプチド鎖の形成において、タンパク質の生合成を阻害する。この混乱は、Rpp40の機能またはその制御過程に必要なタンパク質の利用可能性の減少につながり、それによってタンパク質の活性が阻害される可能性がある。プラジエノライドBはSF3b複合体に結合し、スプライシングを阻害することで、Rpp40が関与するプレRNAプロセシングと成熟を阻害する可能性がある。

さらに、eIF4A阻害剤であるシルベストロールとロカグラミドは、Rpp40と相互作用したり、Rpp40を制御したりするタンパク質の合成を阻害する。CX-5461はRNAポリメラーゼIを阻害し、リボソームRNA合成を減少させるので、rRNAプロセシングにおける役割を考えると、Rpp40の機能を阻害している可能性が高い。トリプトライドはRNAポリメラーゼIIを阻害することでRNAとタンパク質のレベルを低下させ、Rpp40のリボヌクレアーゼ活性に必要な基質を減少させる。ツニカマイシンはN-結合型グリコシル化を阻害し、Rpp40を制御する可能性のあるタンパク質や経路に影響を与える。マイカラミドAはタンパク質合成全体を阻害し、Rpp40が処理するタンパク質やRpp40の活性を制御するタンパク質の減少につながる可能性がある。最後に、シクロヘキシミドはタンパク質合成における転位ステップを阻害し、相互作用タンパク質や調節タンパク質の利用可能性を制限することによって、Rpp40の機能を阻害する。それぞれの化学物質は、そのユニークな作用機序によって、最終的にRNAプロセシングにおけるRpp40の役割を阻害することになる。