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PNKCRISPR激活质粒(h) | sc-404266-ACT | 20 µg | CNY2986.00 |
人类 PNKP 基因编码多核苷酸激酶 3′-磷酸酶(PNK),这是一种双功能的 DNA 末端加工酶,可在 DNA 单链断裂修复过程中恢复连接反应所需的 5′-磷酸和 3′-羟基末端。PNK 作用于 PARP1 和 XRCC1 的下游,通过处理由活性氧、电离辐射以及拓扑异构酶反应异常终止所产生的受损 DNA 末端,与碱基切除修复和非同源末端连接等通路相衔接。通过这些途径,PNKP 有助于维持基因组稳定性,并支持增殖细胞和终末分化细胞中的正常复制与转录。PNKP 介导的末端加工受损会导致对基因毒性应激的敏感性升高,并与因 DNA 修复能力缺陷而产生的神经发育及神经退行性表型相关。
PNK CRISPR激活质粒(h)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性PNKP的表达。
PNK CRISPR激活质粒(h)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的PNKP基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于PNKP转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性PNK表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的PNKP位点,并能够研究内源性位点上依赖于PNK的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在PNKP表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟PNK通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。