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hnRNP ICRISPR激活质粒(m) | sc-422470-ACT | 20 µg | CNY2986.00 | |||
hnRNP ICRISPR激活质粒(m2) | sc-422470-ACT-2 | 20 µg | CNY2986.00 |
小鼠 Ptbp1 基因编码异质核核糖核蛋白 I(hnRNP I/PTBP1),这是一种 RNA 结合蛋白,调控前体 mRNA 的可变剪接、3′ 端加工、mRNA 稳定性以及依赖内部核糖体进入位点(IRES)的翻译。hnRNP I 通过控制与神经元分化、增殖和代谢适应相关网络中的外显子选择,塑造组织特异性的转录本程序,并影响细胞状态转换。通过对 RNA 成熟与翻译的协同调控,PTBP1 与调节细胞骨架重塑和应激反应性基因表达的通路发生联系。PTBP1 活性失调与 RNA 剪接图谱的改变相关,这些改变涉及神经发育表型以及肿瘤发生过程中基因表达程序的重塑,因此 PTBP1 是开展 RNA 加工机制研究的有用靶标。
hnRNP I CRISPR激活质粒(m)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性Ptbp1的表达。
hnRNP I CRISPR激活质粒(m)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的Ptbp1基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于Ptbp1转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性hnRNP I表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的Ptbp1位点,并能够研究内源性位点上依赖于hnRNP I的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在Ptbp1表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟hnRNP I通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。