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DDB1CRISPR激活质粒(m) | sc-419966-ACT | 20 µg | CNY2986.00 | |||
DDB1CRISPR激活质粒(m2) | sc-419966-ACT-2 | 20 µg | CNY2986.00 |
小鼠 DDB1(损伤特异性 DNA 结合蛋白 1)是 CUL4–DDB1 E3 泛素连接酶复合体的核心衔接蛋白,负责协调依赖泛素的调控蛋白周转过程,这些蛋白参与基因组维持。DDB1 通过组装底物受体并在基因毒性应激后调控蛋白稳态,参与核苷酸切除修复、DNA 复制许可、染色质重塑以及细胞周期进程。通过这些通路,DDB1 会影响复制应激反应以及与细胞增殖和分化相关的转录程序。DDB1 相关的泛素信号与 DNA 修复回路的失调,常在基因组不稳定性与肿瘤相关生物学的模型中被研究。
DDB1 CRISPR激活质粒(m)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性Ddb1的表达。
DDB1 CRISPR激活质粒(m)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的Ddb1基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于Ddb1转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性DDB1表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的Ddb1位点,并能够研究内源性位点上依赖于DDB1的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在Ddb1表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟DDB1通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。