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Cdx1CRISPR激活质粒(h) | sc-402522-ACT | 20 µg | $397.00 |
CDX1 编码尾型同源盒(caudal type homeobox)转录因子 Cdx1。Cdx1 是一种序列特异性的 DNA 结合调控因子,有助于建立前后轴(anterior–posterior)模式并引导肠道上皮分化。在人类细胞中,CDX1 与 Wnt/β-连环蛋白以及视黄酸响应性转录程序等发育信号网络整合,控制谱系限制性的基因表达与上皮成熟。CDX1 表达异常与胃肠道组织中上皮命运改变和分化状态失衡有关,因此可作为研究疾病相关模型中转录重编程的有用分子抓手。作为同源盒调控因子,Cdx1 也常用于探究顺式调控元件与染色质环境如何塑造细胞身份决策。
Cdx1 CRISPR激活质粒(h)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性CDX1的表达。
Cdx1 CRISPR激活质粒(h)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的CDX1基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于CDX1转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性Cdx1表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的CDX1位点,并能够研究内源性位点上依赖于Cdx1的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在CDX1表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟Cdx1通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。