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CARPCRISPR激活质粒(h) | sc-401842-ACT | 20 µg | CNY2986.00 |
人类 ANKRD1 基因编码心肌锚蛋白重复结构域蛋白(cardiac ankyrin repeat protein,CARP)。CARP 是一种应激反应型转录共因子,在横纹肌中富集,可在肌节与细胞核之间穿梭。CARP 通过调控与肌节组织、细胞骨架重塑以及心肌发育相关的基因表达程序来整合机械刺激与肥大信号,其中包括与 YAP/TEAD 及 NF-κB 相关信号通路等转录调控因子的相互作用。ANKRD1/CARP 表达的改变与心肌病相关重构以及更广泛的肌肉应激表型有关,因此是解析机械转导与转录适应的重要研究靶点。利用 ANKRD1 扰动的体外模型常用于研究收缩相关基因网络、肌原纤维完整性以及应激诱导的转录组变化。
CARP CRISPR激活质粒(h)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性ANKRD1的表达。
CARP CRISPR激活质粒(h)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的ANKRD1基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于ANKRD1转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性CARP表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的ANKRD1位点,并能够研究内源性位点上依赖于CARP的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在ANKRD1表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟CARP通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。