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AOF1CRISPR激活质粒(h) | sc-405078-ACT | 20 µg | CNY2986.00 |
人源 KDM1B(AOF1)编码一种 FAD 依赖性的赖氨酸去甲基化酶,优先去除 H3K4me1/2 标记,从而塑造染色质可及性与转录输出。通过调控组蛋白甲基化状态,AOF1 参与细胞身份程序的表观遗传调控,包括分化、基因组稳定性,以及生殖系或早期发育阶段的转录控制。KDM1B 的活性与更广泛的染色质重塑及转录抑制/激活网络相互耦联,进而影响调控细胞增殖与谱系承诺的通路。组蛋白去甲基化失衡以及 KDM1B 表达模式改变,与多种疾病相关情境中观察到的表观遗传紊乱有关,包括癌症与发育表型等。
AOF1 CRISPR激活质粒(h)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性KDM1B的表达。
AOF1 CRISPR激活质粒(h)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的KDM1B基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于KDM1B转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性AOF1表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的KDM1B位点,并能够研究内源性位点上依赖于AOF1的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在KDM1B表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟AOF1通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。