DDX40 抑制因子

常见的 DDX40 抑制剂包括但不限于 Flavopiridol CAS 146426-40-6、DRB CAS 53-85-0、Silvestrol CAS 697235-38-4、Rocaglamide CAS 84573-16-0 和 Pladienolide B CAS 445493-23-2。

DDX40 的化学抑制剂包括一系列干扰 RNA 处理和翻译各个阶段的化合物，而 DDX40 螺旋酶的活性取决于这些阶段。黄酮哌啶醇就是这样一种抑制剂，它以 CDK9 为靶标，CDK9 是一种参与 RNA 聚合酶 II 磷酸化的激酶。这种磷酸化是 mRNA 加工和成熟的关键步骤，也是 DDX40 所参与的翻译过程的前奏。通过抑制 CDK9，黄酮哌啶醇间接限制了 DDX40 可作用的成熟 mRNA 模板的可用性。另一种化合物 5,6-二氯-1-beta-D-呋喃核糖基苯并咪唑会破坏 RNA 螺旋酶 A 的功能。这种干扰会降低 RNA 二级结构解旋的效率，而这一过程对 DDX40 在 RNA 代谢中的正常运作至关重要。

在翻译起始途径的下游，Hippuristanol、Pateamine A、Silvestrol 和 Rocaglamide 通过与真核生物起始因子 4A（eIF4A）结合发挥抑制作用。通过抑制 eIF4A，这些化合物可以降低 RNA 翻译所需的螺旋酶活性，从而降低 DDX40 的功能能力。在 RNA 剪接方面，Pladienolide B 和 Spliceostatin A 以剪接体的成分为靶标。众所周知，DDX40 与 RNA 剪接有关，这些抑制剂会损害剪接体从预 mRNA 中准确去除内含子的能力，从而可能抑制 DDX40 的剪接相关活动。另一方面，TBHQ 会损害蛋白质折叠机制，导致 DDX40 蛋白折叠不当，从而降低其螺旋酶活性。苏拉明和 GX15-070 是能破坏蛋白质间相互作用的抑制剂。通过阻止 DDX40 与其必要的 RNA 或蛋白质伙伴相互作用，这些化合物可以抑制 DDX40 的螺旋酶功能。这种对 DDX40 活性至关重要的相互作用的破坏会导致其调节 RNA 结构和影响 RNA 代谢的能力下降。