BC049762阻害剤

一般的なBC049762阻害剤には、メトトレキサート CAS 59-05-2、エトポシド（VP-16） CAS 33419-42-0、 ミトラマイシンA CAS 18378-89-7、クロモマイシンA3 CAS 7059-24-7、トリコスタチンA CAS 58880-19-6などがある。

Myb/SANTのDNA結合ドメイン5様体の化学的阻害剤は、DNAと相互作用するタンパク質の能力を直接阻害する様々なメカニズムによって阻害作用を発揮することができる。ジヒドロ葉酸還元酵素のよく知られた阻害剤であるメトトレキサートは、DNA合成に不可欠なプリンヌクレオチドとチミジル酸の利用可能性を減少させ、その結果、5様体を含むMyb/SANT DNA結合ドメインのようなタンパク質によるDNAの結合を阻害する。エトポシドはトポイソメラーゼIIを標的とする。トポイソメラーゼIIはDNAのトポロジーを調節する酵素で、DNA結合タンパク質の適切な機能にとって重要である。ミトラマイシンAとクロモマイシンA3は、DNAのGCリッチ配列に特異的に結合し、Myb/SANT DNA結合ドメインがゲノム上の通常の結合部位にアクセスするのを阻害する可能性がある。

さらに、トリコスタチンAのような化合物はヒストン脱アセチル化酵素を阻害し、それによってクロマチンランドスケープを変化させ、5様体を含むMyb/SANT DNA結合ドメインへのDNAの接近性を変化させる可能性がある。ダウノルビシンのDNAへのインターカレーションは、トポイソメラーゼIIの阻害とともに、DNA構造と関連する結合プロセスを破壊する。アクチノマイシンDは、転写開始複合体への結合で際立っており、Myb/SANT DNA結合ドメイン含有5様タンパク質のDNA結合ドメインと直接競合し、その機能を阻害する。ミトキサントロンもまた、DNAをインターカレートし、トポイソメラーゼIIを阻害することによって二重の機能を発揮し、Myb/SANT DNA結合ドメイン含有5様体がDNAと適切に相互作用するのを阻害する可能性がある。ジスタマイシンAとネトロプシンはDNAの小溝を標的とし、ジスタマイシンAはATに富んだ領域を好み、ネトロプシンはATに富んだ配列を好むので、5様体を含むMyb/SANT DNA結合ドメインがこれらの特定のDNA領域に結合するのを妨げる可能性がある。最後に、アクラルビシンはDNAと結合してトポイソメラーゼIIを阻害するが、カンプトテシンはトポイソメラーゼIを特異的に阻害し、DNAの損傷を引き起こす。このため、Myb/SANT DNA結合ドメイン含有5様体のDNA結合活性を阻害することができる。