YTHDF1 Inhibidores

Entre los inhibidores comunes de YTHDF1 se incluyen, entre otros, el ácido aurintricarboxílico CAS 4431-00-9, el azul de metileno CAS 61-73-4, la cloroquina CAS 54-05-7, la emetina CAS 483-18-1 y el clorhidrato de daunorrubicina CAS 23541-50-6.

Los inhibidores químicos de YTHDF1 interfieren con su capacidad para unirse al ARN modificado con m6A, un aspecto crucial de su función en el metabolismo del ARN. La rodamina 6G, el azul de metileno, la cloroquina, la daunorrubicina, la doxorrubicina y la elipticina actúan a través de un mecanismo en el que se intercalan en el ARN. Esta intercalación probablemente obstruye los sitios de unión en el ARN, impidiendo que YTHDF1 acceda a sus objetivos. El yoduro de propidio comparte un modo de acción similar, insertándose en la estructura del ARN y compitiendo potencialmente con YTHDF1 por la interacción con los sitios m6A. Por otro lado, el Eriochrome Black T utiliza un enfoque distinto al quelar iones metálicos, que son vitales para la integridad estructural y la función de YTHDF1, impidiendo así su capacidad de unión al ARN.

El ácido aurintricarboxílico actúa bloqueando la interacción entre los ácidos nucleicos y las proteínas, inhibiendo así la unión de YTHDF1 a los sitios m6A del ARN. La emetina utiliza una estrategia inhibidora diferente en la que se une al ARN ribosómico, lo que puede dar lugar a un impedimento estérico o inducir cambios conformacionales en el ARN ribosómico, dando lugar a una menor interacción entre YTHDF1 y sus dianas de ARN modificadas con m6A. La mitoxantrona comparte un mecanismo similar al de los agentes intercalantes, pero su estructura química es distinta. La actinomicina D, aunque no impide directamente la función de YTHDF1, se une al ADN y dificulta la transcripción del ARN, lo que a su vez podría reducir la disponibilidad global de ARN para la unión de YTHDF1. Cada una de estas sustancias químicas, a través de sus respectivos modos de acción, interrumpe la función normal de YTHDF1 en el procesamiento de moléculas de ARN modificadas con m6A.